物种形成是新生物多样性产生的基础。然而，在物种形成过程中，自然选择是如何塑造基因组的，还有很多需要了解。假设选择作用于障碍位点的基因流，促进生殖隔离。然而，基因流动和选择的证据往往是间接的，我们对障碍基因座的时间稳定性知之甚少。在这里，我们利用单倍体二倍体来确定两种木蚁杂交种的候选雄性屏障基因座。由于雄性蚂蚁是单倍体，它们被期望揭示隐性障碍位点，如果杂合，二倍体雌性蚂蚁可以掩盖隐性障碍位点。然后，我们在十年后收集的样本中测试屏障稳定性，并使用生存分析提供作用于候选雄性屏障位点的自然选择的直接测量。我们发现多个候选男性屏障基因座散布在整个基因组中。令人惊讶的是，它们中的一部分在十年后并不稳定，自然选择在随后的样本中显然从反对进化转变为赞成进化。渗透效应的不稳定性和内向等位基因的自然选择可能是由于环境相关的选择，强调需要考虑自然选择强度的时间变化和在未来物种形成工作中假定的屏障位点的屏障效应的稳定性。